Anche la Svizzera, in seguito alle predicazioni di Giovanni Calvino, si staccò da Roma. Il calvinismo si diffuse rapidamente in Ungheria, Francia, Paesi Bassi, Scozia. In Italia i valdesi, seguaci di Pietro Valdo, adottarono la dottrina calvinista. Contro la Riforma protestante la chiesa di Roma creò il Sant’Uffizio e riorganizzò il tribunale dell’Inquisizione. Nacquero nuovi ordini religiosi, tra cui la potente Compagnia di Gesù.